Saints Row 3 è il terzo capitolo della serie Saints Row. La storia riprende con la banda dei Saints che, dopo la fusione con la Ultor Corporation, sono diventati delle vere e proprie icone nei media di tutto il mondo. Nonostante la fama e l'enorme successo, continuano tranquillamente con la loro attività criminale. All'inizio della vicenda, il Boss dei Saints, Johnny Gat e Shaundi decidono di rapinare una banca a Stilwater con Josh Birk. Nel corso del colpo, la situazione si fa sempre più difficile e dopo aver tenuto a bada decine di membri dell'unità Swat mentre cercano di portare via la cassaforte dalla banca, Pierce perde il controllo del velivolo scontrandosi contro un elicottero corazzato, mentre il Boss, Shaundi e Johnny vengono arrestati e incarcerati per colpa di un colpo di testa di Josh.
La loro detenzione, però, dura poco perchè una misteriosa organizzazione criminale, conosciuta come The Syndicate, paga la loro cauzione e li cattura per conto di Philippe Loren, capo della suddetta organizzazione. Sul suo jet privato, il cinico belga cerca di trovare un accordo per lasciarli in vita (il 66% del dominio economico e criminale del gruppo Saints-Ultor a Stilwater) ma non si scherza con i Saints. Prima che possano eliminarli, Johnny si libera e inizia a fare casino. Durante la colluttazione contro i Morning Stars, Loren lo pugnala vigliaccamente, mentre la sua faccia viene sbattuta con violenza da Johnny contro un finstrino del jet. Durante tutto il caos che ne consegue, il Boss e Shaundi riescono a scappare, mentre il nostro Gat continua a divertirsi con la carneficina. Dopo essersi fatti strada per tutto il jet, quando stanno per buttarsi dall'aereo, non riescono a contattare Johnny, per via di una smitragliata nella cabina che distrugge l'interfono. Incerti sul destino di Gat, il Boss e Shaundi riescono a raggiungere Steelport, una città sotto il controllo del Syndicate. Dopo che le altre bande affiliate all'organizzazione svuotano i loro conti bancari, il Boss, insieme a Shaundi e a Pierce (sfuggito alla cattura), riorganizzano la banda e si preparano a contrattaccare per vendicarsi e per conquistare l'intera Steelport, con l'inimitabile stile Saint.
